Enzym PapB zamyka peptydy lekowe w trwałe pierścienie

Naukowcy z University of Utah odkryli, że enzym PapB z grupy maturaz radical SAM potrafi modyfikować C-koniec liniowych peptydów terapeutycznych, tworząc wiązanie tioeterowe z resztą cysteiny i zamykając cząsteczkę w stabilną strukturę makrocykliczną. W przeciwieństwie do klasycznych enzymów modyfikujących peptydy, PapB nie wymaga sekwencji liderowej (leader sequence) do rozpoznania substratu, co czyni go narzędziem uniwersalnym […]

Czytaj więcej

AI projektuje allosteryczne przełączniki białkowe działające jak biosensory

Międzynarodowy zespół kierowany przez prof. Kirilla Aleksandrova z Queensland University of Technology (QUT) wykorzystał uczenie maszynowe (machine learning) do zaprojektowania sztucznych białek pełniących funkcję allosterycznych przełączników molekularnych — aktywujących się wyłącznie w obecności wybranego analitu. W odróżnieniu od naturalnych białek sensorowych nowe konstrukty nie wymagają dużych, globalnych zmian konformacyjnych — wystarczają subtelne zmiany w dynamice […]

Czytaj więcej

Światło kieruje ewolucją białek — nowa metoda „optowolucji”

Naukowcy z EPFL opracowali technikę nazwaną optowolucją (ang. optovolution), która wykorzystuje światło do kierowania ewolucją białek o dynamicznych funkcjach. Metoda polega na zaprzęgnięciu drożdży Saccharomyces cerevisiae do selekcji wariantów białek, które przełączają się między stanami w odpowiedzi na impulsy świetlne — komórki z najlepiej działającymi wariantami przeżywają każdy cykl podziałowy trwający około 90 minut. Dzięki […]

Czytaj więcej