Białko DHX29 odczytuje „drugi kod” mRNA i wycisza niestabilne geny

Zespół naukowców z Uniwersytetu w Kioto odkrył mechanizm, dzięki któremu komórki ludzkie rozróżniają wydajne i niewydajne kodony w mRNA, selektywnie wyciszając te ostatnie. Kluczową rolę w tym procesie odgrywa białko DHX29 — helikaza RNA, która wiąże się z rybosomem odczytującym rzadkie kodony (nonoptimal codons) i rekrutuje kompleks białkowy GIGYF2–4EHP, inicjujący degradację danego transkryptu. Za pomocą […]

Czytaj więcej

Nowe narzędzie AI projektuje syntetyczne wzmacniacze ekspresji genów

Zespół prof. Steina Aertsa z VIB i KU Leuven opublikował w Nature Methods oprogramowanie CREsted (cis-regulatory element sequence training, explanation and design) — platformę opartą na uczeniu głębokim (deep learning), która umożliwia analizę i projektowanie sekwencji wzmianiających ekspresję genów (enhancerów) specyficznych dla danego typu komórki. Narzędzie integruje przetwarzanie danych o dostępności chromatyny z pojedynczych komórek, […]

Czytaj więcej