biologia syntetyczna

Kolejność genów wpływa na superzwijanie DNA i moduluje ekspresję sąsiadów

A22328

Zespół z Massachusetts Institute of Technology kierowany przez Kate Galloway wykazał, że tzw. składnia genowa (gene syntax) — czyli wzajemna orientacja sąsiadujących genów — determinuje lokalne superzwijanie DNA i w konsekwencji moduluje poziom transkrypcji genów położonych nawet 2000 par zasad dalej. Wykorzystując technikę Region Capture Micro-C, badacze zobrazowali, jak aktywacja genu powoduje zwijanie się DNA […]

Czytaj więcej

AI projektuje allosteryczne przełączniki białkowe działające jak biosensory

A22272

Międzynarodowy zespół kierowany przez prof. Kirilla Aleksandrova z Queensland University of Technology (QUT) wykorzystał uczenie maszynowe (machine learning) do zaprojektowania sztucznych białek pełniących funkcję allosterycznych przełączników molekularnych — aktywujących się wyłącznie w obecności wybranego analitu. W odróżnieniu od naturalnych białek sensorowych nowe konstrukty nie wymagają dużych, globalnych zmian konformacyjnych — wystarczają subtelne zmiany w dynamice […]

Czytaj więcej

Polimerazy DNA potrafią tworzyć złożone sekwencje bez matrycy

A22219

Naukowcy z Uniwersytetu w Bristolu wykazali, że polimerazy DNA — enzymy odpowiedzialne za kopiowanie materiału genetycznego — potrafią samodzielnie syntetyzować złożone sekwencje DNA bez żadnej matrycy. Zjawisko niematrycowej aktywności polimerazy (untemplated synthesis) jest znane od lat 60. XX wieku, jednak dopiero teraz, dzięki sekwencjonowaniu nanoporowemu (nanopore sequencing), udało się szczegółowo scharakteryzować jego złożoność — od […]

Czytaj więcej

„Komórki zombie” — przeszczep genomu ożywia martwe bakterie

A22216

Zespół z J. Craig Venter Institute opracował metodę przeszczepiania całego genomu (whole genome transplantation, WGT) do martwych komórek bakteryjnych, tworząc pierwsze żywe komórki syntetyczne zbudowane wyłącznie z nieżywych elementów. Naukowcy uśmiercili komórki Mycoplasma capricolum za pomocą mitomycyny C, która usieciowuje DNA i trwale inaktywuje genom biorcy, a następnie wprowadzili do nich syntetyczny genom Mycoplasma mycoides. […]

Czytaj więcej